تم افتتاح قسم العلوم الطبية المخبرية بالجامعة الإسلامية في العام 1992-1991 وذلك انطلاقا من حرص الجامعة على تقديم خدمات مجتمعية من خلال تناول الموضوعات التي تهمه وذلك بتطوير الخبرات السليمة الذكية للعاملين في مجال التحاليل الطبية وتخريج كوادر متخصصة في هذا المجال ولقد بدأ القسم بتسعة طلاب وطالبة واحدة عام 1991 ويدرس الآن في قسم العلوم الطبية المخبرية ما يقارب ثلاثمائة طالب وطالبة.
و قد واكب هذا التطور في عدد الطلبة تطوراً نوعياً حيث تم تزويد مختبرات القسم بأجهزة نوعية كما تم تعيين عدد من الأساتذة ذوى الكفاءة العالية. حاز القسم على ثقة وزارة الصحة، وأثبت الطلبة خريجو وخريجات القسم تفوق مستوى التحاليل الطبية وذلك أثناء تدربهم في مختبرات الوزارة مما دفع وزارة الصحة إلى توظيف عدد كبير منهم. وعلى مدار الفترة الزمنية السابقة تم إحلال معظم المواقع الهامة في وزارة الصحة بخريجي قسم العلوم الطبية المخبرية من الجامعة الإسلامية وذلك لتميز هؤلاء الخريجين بالمستوى العلمي المتميز والنظرة الثقافية في تحليل الأمور ومتابعة التطورات والاكتشافات في المجالات الطبية.
كما ويعمل خريجي القسم في مجالات متعددة منها على سبيل الذكر: المختبرات الطبية لوزارة الصحة والمختبرات الطبية الخاصة ومختبرات شركات الأدوية والمصانع البيولوجية المختلفة كمصانع الألبان.
يتم القبول في قسم العوم الطبية المخبرية لطالب كلية العلوم بعد إتمام الفصل الأول وإنهاء مساقات كيمياء عامة أ وأحياء عامة أ على أن يكون الطالب قد حصل على معدل 70% فما فوق في هذه المساقات.
كما يمكن لخريج القسم الالتحاق ببرامج الدراسات العليا حيث يستطيع خريج القسم الالتحاق ببرنامج الماجستير في التحاليل الطبية وفق شروط الالتحاق.