يضم قسم العلوم الطبية المخبرية عدداً من المختبرات العلمية لتدريس الطلبة المساقات العملية وخدمة المجتمع الفلسطيني منها:
ويضم فحوصات متعددة في مجال الكشف عن البكتيريا والطفيليات الممرضة وطرق تشخيص الأمراض التي تسببها البكتيريا والطفيليات.
وتضم فحوصات متعلقة بالدم وتشخيص الأمراض التي تصيب خلايا الدم البيضاء والحمراء.
ويضم الفحوصات التي تكشف عن كميات البروتين والدهون والسموم بالدم.
يضم إجراء الفحوصات الوراثية التي من خلالها يتم تشخيص الأمراض الوراثية.