يعتبر قسم البصريات الطبية أحد أقسام كلية العلوم التي لها مواصفات خاصة، حيث أنه قسم طبي وعلمي في آن واحد، وقد تم افتتاحه حديثاً لتغطية الحاجة الماسة لمثل هذا التخصص في بلدنا الحبيب، ولاسيما أن تخصص البصريات الطبية هو من التخصصات النادرة في العالم، ويشكل افتتاح هذا القسم في الجامعة الإسلامية نقلة نوعية في تطور الجامعة ومجاراتها للعلوم الراقية في أعرق الجامعات الغربية.